Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PpcsQ8VDG5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PpcsQ8VDG5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms