Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fyco1Q8VDC1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms