Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RfxapQ8VCG9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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