Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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