Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms