Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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