Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms