Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ssh3Q8K330 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssh3Q8K330 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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