Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf39Q8K2Z2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms