Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700001C19RikQ8K168 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms