Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ep400Q8CHI8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms