Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms