Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms