Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Usp27Q8CEG8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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