Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RybpQ8CCI5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms