Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Col6a6Q8C6K9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Col6a6Q8C6K9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col6a6Q8C6K9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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