Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930572O03RikQ8C5Y0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930572O03RikQ8C5Y0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms