Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rae1Q8C570 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rae1Q8C570 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rae1Q8C570 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rae1Q8C570 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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