Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka5Q8C050 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms