Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vps13cQ8BX70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps13cQ8BX70 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms