Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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