Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pggt1bQ8BUY9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pggt1bQ8BUY9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pggt1bQ8BUY9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pggt1bQ8BUY9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pggt1bQ8BUY9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms