Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gga3Q8BMI3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms