Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf18Q8BM39 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf18Q8BM39 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms