Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy1Q8BIJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms