Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smndc1Q8BGT7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smndc1Q8BGT7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms