Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms