Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Katnb1Q8BG40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms