Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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