Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms