Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NanogQ80Z64 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms