Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims3Q80U57 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms