Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ckap2lQ7TS74 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms