Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Actn1Q7TPR4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms