Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp3Q7TNH6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nphp3Q7TNH6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms