Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trappc6aQ78XR0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc6aQ78XR0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6aQ78XR0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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