Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TwistnbQ78WZ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms