Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SynmQ70IV5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms