Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms