Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms