Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnip1Q6QD59 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms