Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms