Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med16Q6PGF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms