Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmeff1Q6PFE7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms