Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vstm2lQ6PDS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm2lQ6PDS0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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