Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms