Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg2aQ6P4T0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg2aQ6P4T0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms