Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Szrd1Q6NXN1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms