Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cntn4Q69Z26 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms