Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem1Q684R7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Frem1Q684R7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Frem1Q684R7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Frem1Q684R7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Frem1Q684R7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Frem1Q684R7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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